S-HYPE bygger på SVAR:s uppdelning i avrinningsområden. Egenskaper inom ett område såsom markanvändning, jordarter och olika punktkällor hämtas från tillgängliga databaser och statistik. Detta innebär att S-HYPE inte har kunskap om exakt var till exempel industrier, enskilda avlopp och viss markanvändning finns. Systemet har inte heller kunskap om förändringar som skett efter databasens upprättande.
S-HYPE ger generellt en bra bild av flöden och näringsämnen för Sverige. Det finns dock delar av Sverige där den ger något sämre uppskattningar. Se Vattenwebbs produkt Utvärdera modellresultat för sötvatten för mer information hur väl S-HYPE:s beräkningar förhåller sig till uppmätta värden i det område du är intresserad av.
Scenarioverktyget innebär en ytterligare förenkling av detta och räknar med årsmedelvärden av retentioner från HYPE och ignorerar effekterna av säsongsvariationer. Beräkningarna har utvärderats och stämmer i nuläget mycket bra överens med S-HYPE:s beräkningar.
Scenarioförändringar i verktyget har jämförts med beräkningar gjorda med den fullständiga S-HYPE. I de flesta områden är skillnaden i belastning i storleksordningen 1 % mellan verktygets beräkningar och körningar gjorda med en fullständig S-HYPE. I ett fåtal områden kan dock skillnaden bli större. Vid oförändrad belastning är dock skillnaden även här cirka 1 %, medan det vid ett scenario med en ändring på 25 % av totalbelastningen kan skilja ungefär 10 % mellan verktyget och S-HYPE.
Det bör noteras att S-HYPE är utvecklad och kalibrerad för dagens belastning. De processer som modelleras påverkas av belastningen och det är idag svårt att kalibrera en modell mot ett tänkt scenario eftersom det inte finns mätdata att verifiera en sådan modell mot. Projekt finns för att på längre sikt möjliggöra utvärdering av modeller vid förändringar.
Detta innebär att resultaten vid stora förändringar bör ses som en indikation på effekten och därför tolkas med försiktighet. Det är också viktigt att beakta att det i ett verkligt scenario kan ta lång tid innan en förändring realiseras.