Leverera data till datavärdskapet för oceanografi och marinbiologi
Här presenteras information om hur data ska formateras och levereras. Som stöd finns rapporteringsmallar som täcker flera olika provtagningsupplägg.
För närvarande genomför SMHI och Havs- och vattenmyndigheten tillsammans med andra berörda myndigheter en utredning om hur handläggande av spridningstillstånd för data ska hanteras utifrån lagen (2016:319) om skydd för geografisk information. Så länge utredningen pågår har SMHI inte möjlighet att öppet tillhandahålla geografisk information inom svenskt sjöterritorium och kan inte heller ta emot dataleveranser som omfattas av lagen. Data utanför territorialgränsen som redan har hanterats av datavärdskapet finns att tillgå via Shark. Frågor angående datainnehåll på Shark hänvisas till shark@smhi.se.
Det betyder att Datavärdskapet för oceanografi och marinbiologi samt NODC inte tar emot data som innehåller information om förhållanden i ett visst vattenområde inom Sveriges sjöterritorium, så som bottenlevande arter, bottendjup, provtagningsdjup, sediment och/eller substrat, som saknar spridningstillstånd.
Så levererar du data till datavärdskapet
- Kontakta miljodatahantering@havochvatten.se om du är osäker på om din data innehåller uppgifter som kräver tillstånd för att få spridas.
- Mejla miljodatahantering@havochvatten.se och be om rätt mall för dina data. Mejla sedan koordinater och metadata enligt mallen, till samma mejladress.
- Invänta besked från Havs- och vattenmyndigheten (HaV) om beslut om spridning. HaV hanterar och skickar ansökningarna om spridningstillstånd till Sjöfartsverket.
- När du fått besked: rapportera data och beslutet om spridningstillstånd till datavärdskapet.
- Välj rapporteringsmall som motsvarar den datatyp som ska levereras. Vi publicerar med jämna mellanrum uppdaterade versioner.
- Fyll i fliken "förklaring" i första Excelfliken och lägg till data enligt mallen. Instruktioner och exempel finns inbäddade i mallen.
- Skicka filen med data med e-post till shark@smhi.se.
- Datavärden meddelar när data tagits emot med kopia till beställaren. Därefter utför datavärden leverans- och kvalitetskontroller och ställer vid behov frågor rörande data.
- Efter godkänd kvalitetskontroll paketerar datavärden leveransen med eventuell ändringar och publicerar data på Shark.
Du som ska rapportera data till NODC
Kontakta shark@smhi.se
Mallar för rapportering, verktyg och stöd finns lägre ner på sidan.
Mallar för rapportering
Följande dataformat tas emot av datavärden.
Delprogram Fria vattenmassan
Beskrivning | Rapporteringsmall |
|---|---|
Fysikaliska/kemiska data från olika djup. Klorofyllhalt (diskreta djup) och lågupplöst CTD-data | |
Högupplösta sensordata (exempelvis CTD-, MVP-data) | Profil (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Klorofyllhalt (integrerat prov) | Klorofyll (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Primärproduktion (inkuberingsmetod) | |
Växtplankton, Picoplankton | Växtplankton (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Djurplankton | Djurplankton (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Geléplankton | Geléplankton (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Bakterieplankton | Bakterieplankton abundans (.xlsx) Länk till annan webbplats.Bakterieplankton produktion (.xlsx) |
Sedimentation | Sedimentation (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Delprogram Makrofauna mjukbotten
Beskrivning | Rapporteringsmall |
|---|---|
Mjukbottenfauna | Mjukbottenfauna (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Delprogram Säl och havsörn
| Beskrivning | Rapporteringsmall |
|---|---|
Gråsäl och knubbsäl | Gråsäl och knubbsäl (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Vikare | Vikare (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Patologi hos gråsäl, knubbsäl och vikare | Sälpatologi (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Tumlare
| Beskrivning | Rapporteringsmall |
|---|---|
Tumlare | Tumlare (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Delprogram Vegetationsbeklädda bottnar
| Beskrivning | Rapporteringsmall |
|---|---|
Registrering av makrovegetation med dyk/snorkel transekt (Allmän mall) | Vegetationsklädda bottnar dyktransekt (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Registrering av makrovegetation med dropvideo (spridningstillstånd krävs) | Vegetationsklädda bottnar dropvideo (xlsx) Länk till annan webbplats. |
Inventering med rutor längs transekt | Kontakta Shark |
Inventering av avsnitt och rutor längs transekt | Kontakta Shark |
Registrering av makrovegetation med verktyget MARTRANS | Kontakta Shark |
Rapportering av djupgränser för makrovegetation | Kontakta Shark |
Kontakta datavärden om du har frågor eller önskar rapportera data som inte passar rapporteringsmallarna ovan, så kontakta datavärden.
Kontakta datavärden vi e-post: shark@smhi.se
Verktyg och stöd
Kodlistor, förklaringar och enhetsomvandling
SMHIs kodlista - Beskrivning av koder i datavärdskapet (xlsx)
Länk till annan webbplats.
Förklaring till kolumner i Shark (xlsx)
Länk till annan webbplats.
ICES conversion of units (ices.dk)
Länk till annan webbplats.
Mall för enhetskonvertering (xlsx)
Länk till annan webbplats.
Arthantering
Artlista (xlsx)
Länk till annan webbplats.
Om arthantering inom datavärdskapet (pdf)
Länk till annan webbplats.
Artdatabankens databas om arter (artfakta.se)
Länk till annan webbplats.
PEG-lista biovolym från HELCOM/ICES (zip-arkiv)
Länk till annan webbplats.
Verktyg för plankton
Information om växtplankton (nordicmicroalgae.org)
Länk till annan webbplats.
